Hayatta sürekli başarısız olan Sahashi Minato; iki kere üniversiteye girmeyi başaramamış, kadınlarla şansı asla yaver gitmemiş, işsiz bir gençtir. Aslında Minato son derece zekidir ancak baskı altında kalınca başarısız olmaktadır. Günün birinde Minato, Musubi adlı bir kızla karşılaşır. Saldırı altında olan Musubi kaçarken Minato'yu da yanında sürükler ve bir süre sonra Minato'nun aslında bir Ashikabi olduğu ortaya çıkar. Ashikabi'ler, 108 güçlü varlığa savaşta yardım edebilecek genetik özelliğe sahip gizemli ustalardır ve eşlerine Sekirei denmektedir. Şirin kızlardan yapılı kadınlara ve yakışıklı oğlanlara kadar çeşitli Sekirei'ler mevcuttur fakat Sekirei dövüşleri çok tehlikeli, hatta kimi zaman da ölümcüldür Savaş alanına dönen Tokyo'da Sekirei'ler eşleri Ashikabi'eri ararken Minato, Musubi'nin eşi olur ancak bir süre sonra bir Ashikabi'nin birden fazla eşi olabileceğini öğrendiğinde işi gittikçe zorlaşmaya başlar.